Anatómicas: explican la existencia de distintos órganos: Homólogos: mismo origen, estructura interna, pero distinta funcion al sufrir divergencia adaptativa, tienen un origen común, pero como función diferente se diferencian. Análogos: misma función, distinto origen y estructura al tener una convergencia adaptativa. Vestigiales:organos primitivos no funcionales, atrofiados y desaparecen. Paleontológicas: estudio de fósiles. Series filogénicas: conjuntot de fósiles de un grupo de seres vivos ordenados de mayor a menos antiguedad. Formas intermedias: fósiles de una especie con características de 2 grupos.
Embriológicas: desarrollo embrionario de distintas especies, se comprueba que en las primeras fases del desarrollo se parecen mucho, origen común de ellos.
Biogeográficas: distribución geográfica de seres vivos, barreras geográficas suponen distinta evolución a un lado y otro de la barrera.
Bioquímicas: moléculas de los seres vivos,cuando mayor es el parecido de las moléculas más cerca están esos seres vivos en la escala evolutiva.
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